原核细胞和真核细胞存在多方面的区别，主要包括以下几点：

细胞核构造：

原核细胞：没有以核膜爲界的真正细胞核，遗传物质集中在一个没有明白界线的低电子密度区，称爲拟核。拟核中的 DNA 爲暴露的环状分子，通常没有结合蛋白。真核细胞：具有真正的细胞核，细胞核被核膜解围，核内有核仁。遗传物质（DNA）与组蛋白等蛋白质共同组成染色体构造，在核内可看到核仁，染色体数在一个以上。

细胞器方面：

原核细胞：细胞器只要核糖体一种，没有线粒体、内质网、高尔基体、溶酶体等复杂的细胞器。不过，局部原核细胞能够会有一些特殊的构造，如细菌的中膜体可起到相似线粒体的功用，但与真核细胞的线粒体在构造和功用上有实质区别。真核细胞：具有多种复杂的细胞器，这些细胞用具有各自特定的功用，如内质网参与蛋白质的加工和运输；高尔基体参与蛋白质的分类、

包装和分泌；线粒体是细胞停止有氧呼吸的次要场所；溶酶体含有多种水解酶，可停止细胞内的消化作用等。细胞大小：原核细胞：普通较小，通常在 0.5 至 5 微米之间。真核细胞：通常比原核细胞大，普通在 10 至 100 微米之间，局部真核细胞如鸵鸟的卵细胞，直径可达几厘米，人的坐骨神经细胞可长达 1 米。

细胞分裂方式：

原核细胞：次要以二分裂的方式停止繁衍，即一个细胞间接分裂爲两个根本相反的子代细胞。DNA 复制后，细胞随即分裂爲二。

真核细胞：通常停止有丝分裂、减数分裂等方式。有丝分裂是真核细胞最罕见的分裂方式，可保证遗传物质的均匀分配；减数分裂则是发生生殖细胞的进程，关于生物的遗传和变异具有重要意义。局部真核细胞也能停止无丝分裂，如蛙的红细胞。

细胞壁成分：原核细胞：细胞壁的次要成分是肽聚糖。肽聚糖由 N - 乙酰葡糖胺和 N - 乙酰胞壁酸构成双糖单元，以 β（1-4）糖苷键衔接成大分子。

真核细胞：动物细胞的细胞壁次要成分是纤维素和果胶；真菌细胞的细胞壁次要成分是几丁质等。

遗传物质的构造和表达：

原核细胞：基因构造少数以操纵子方式存在，完成同类功用的多个基因聚集在一同，处于同一个启动子的调控之下，下游同时具有一个终止子。转录和翻译进程简直是同时停止的，即在同一空间（细胞质）内停止。

真核细胞：具有复杂的基因调控机制，基因中含有内含子和外显子，转录在细胞核内停止，而翻译在细胞质中的核糖体上停止，转录和翻译在工夫和空间上是分开的。